O biserica construita mai tarziu, avand un acoperis nu prea inalt din ciment, a luat locul primei basilici crestine. Podeaua plina de mozaicuri si numeroase parti arhitecturale sunt pastrate in basilica. Deasemenea se afla si o cripta subterana unde se aflau ramasitele Sfantului Isidore si ale Sfantului Myrope (martiri din perioadele cand crestinismul abia aparuse).
Basilica crestina Sfantul Isidore a fost construita pe ramasitele unei foste cladiri romane. Conform traditiei biserica a fost construita in timpul lui Constantin al-IV-lea Pogonatos, in a doua jumatate a secolului al-7-lea. A trecut prin numeroase reparatii de-alungul timpului probabil cele mai multe in timpul ocupatiei franceze, in perioada bizantina si in timpurile moderne. Se disting cinci faze arhitecturale- prima datand din secolul al-5-lea , insa distrusa de cutremurul din 1881.
G. Soteriou a intreprins primele cercetari arheologice in acest sit inca din 1918. Sapaturile au fost continuate de A.Orlandos in 1928. Au urmat lucrari in primavara anilor 1981 si 1982, de catre Eforatul al-3-lea .
Este intotdeauna deschis.